演化基因體學研究如何洗清「愛滋零號感染者」的長期污名？

圖片來自Worobey et al. Nature http://dx.doi.org/10.1038/nature19827; 2016

自從1980年代以來，許多學者都以為紐約市多宗愛滋病感染個案的感染源頭為一名匿名的男同性戀空中服務員，並推測他就是一名叫作Gaëtan Dugas的空服員。後來的學者多半認為他就是把起源自非洲的HIV病毒散播到西方。然而早在1988年，Andrew Moss在AIDS with End一書中便開始懷疑這個推測。之後在2007年時，2007年11月發表在PNAS《美國國家科學院院刊》由Gilbert et al.所撰寫的論文便拒絕了零號感染者是西方世界HIV爆發感染源頭的假說。

跨物種感染的新型疾病在近年越來越常見，HIV是，禽流感是，SARS是，還有很多疾病都是。這些跨物種感染的疾病的產生經常是因為一開始人與野生動物不必要或不當的接觸所引起。HIV-1與HIV-2兩者都來自非洲中西部，並從靈長類動物傳到人類。HIV-1可能是從黑猩猩的猴免疫缺陷病毒跨種感染演化而來；HIV-2則可能是從幾內亞比索的烏黑白眉猴（Sooty Mangabey, Cercocebus atys）的另一種猴免疫缺陷病毒跨種感染而來。

為什麼會有這種跨物種感染？然後導致原來在野生靈長類動物身上的病毒跑到人類身上？主要是因為食用野生動物的野味交易(bush meat)所引發的 (Kalish et al., 2005, Emerg Infect Dis. 11 (12): 1928–30. doi:10.3201/eid1112.050394)。而這個轉移其實早在19世紀末到20世紀初就出現。

由於過去總是有人認為，愛滋病是由男同性戀所引起並爆發，而且還是從一個叫"零號感染者"的早逝空服員身上出現。然而2016年發表在Nature上的論文(http://www.nature.com/nature/journal/v539/n7627/full/nature19827.html)已經證實，這位零號感染者並非愛滋病在美國大爆發的首位感染者。也就是說HIV演化出來以後進入美國的途徑還經過加勒比海地區，然後也遠早於愛滋病在男同性戀中出現的案例。此外，Healy (1999)的論文(https://kieranhealy.org/files/papers/ts.pdf)也已經指出1980s年代北美洲的感染其實來自血庫的污染。

這個研究之所以能夠順利找到答案得拜演化基因體研究方法所賜。研究人員從保存完好的檢體中獲得大量的核酸序列資訊之後，重建檢體序列之間的親緣關係樹。由分析結果便可顯示所謂的零號感染者之檢體在演化分析中出現在相當晚期，也就是病毒從某些不知名途徑中進入美國相當一段時間之後才被感染。

這也就是說，HIV之所以會跨物種跳到人類身上的途徑非常複雜，並非是一個單一白種男同性戀者所引起。

延伸閱讀：

1. 科學研究還基坦·杜加清白，並非「零號愛滋病感染者」(GreatDaily)
2. HIV’s Patient Zero exonerated (Nature)
3. New HIV Genetic Evidence Dispels “Patient Zero” Myth (Scientific American)